Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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RAB40BQ12829 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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RAB40BQ12829 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RAB40BQ12829 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RAB40BQ12829 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RAB40BQ12829 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RAB40BQ12829 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RAB40BQ12829 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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RAB40BQ12829 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB40BQ12829 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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