Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms