Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOBRQ0VD83 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms