Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP2BQ02880 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP2BQ02880 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms