Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POU5F1Q01860 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms