Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTUD4Q01804 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTUD4Q01804 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms