Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MDM2Q00987 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms