Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HSF1Q00613 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms