Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms