Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXA4Q00056 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXA4Q00056 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXA4Q00056 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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