Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMF1P82094 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMF1P82094 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms