Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTG1P63261 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms