Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-21P61565 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-21P61565 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-21P61565 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-21P61565 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-21P61565 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-21P61565 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-21P61565 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-21P61565 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-21P61565 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-21P61565 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-21P61565 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-21P61565 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-21P61565 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-21P61565 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms