Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMP3P54852 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EMP3P54852 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms