Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP1B3P54709 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms