Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MVDP53602 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MVDP53602 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MVDP53602 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms