Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCAMP50895 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BCAMP50895 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAMP50895 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BCAMP50895 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCAMP50895 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAMP50895 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BCAMP50895 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BCAMP50895 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCAMP50895 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCAMP50895 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms