Protein–RNA interactions for Protein: P49747

COMP, Cartilage oligomeric matrix protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMPP49747 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COMPP49747 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
COMPP49747 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
COMPP49747 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COMPP49747 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COMPP49747 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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