Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITPNBP48739 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms