Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK1A1P48729 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK1A1P48729 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms