Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRXP46100 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRXP46100 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATRXP46100 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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