Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPD2P43304 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GPD2P43304 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPD2P43304 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPD2P43304 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPD2P43304 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GPD2P43304 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPD2P43304 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPD2P43304 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPD2P43304 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPD2P43304 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPD2P43304 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPD2P43304 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPD2P43304 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPD2P43304 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPD2P43304 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPD2P43304 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPD2P43304 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPD2P43304 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPD2P43304 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms