Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRATP43155 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRATP43155 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRATP43155 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms