Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDF5P43026 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDF5P43026 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF5P43026 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms