Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HLA-DMAP28067 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms