Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGA3P26006 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms