Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTAFRP25105 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms