Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HRCP23327 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HRCP23327 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HRCP23327 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HRCP23327 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HRCP23327 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HRCP23327 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HRCP23327 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HRCP23327 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HRCP23327 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HRCP23327 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HRCP23327 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HRCP23327 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HRCP23327 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HRCP23327 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HRCP23327 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HRCP23327 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HRCP23327 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HRCP23327 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HRCP23327 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms