Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
EPHA1P21709 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms