Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDK11BP21127 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms