Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM21P19474 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms