Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLR2CP19387 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLR2CP19387 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms