Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCAP17252 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms