Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCL3L1P16619 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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