Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSPP15924 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSPP15924 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSPP15924 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSPP15924 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms