Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2F2P13984 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms