Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD8BP10966 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD8BP10966 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD8BP10966 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms