Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PKHD1P08F94 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PKHD1P08F94 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PKHD1P08F94 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PKHD1P08F94 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PKHD1P08F94 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PKHD1P08F94 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PKHD1P08F94 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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PKHD1P08F94 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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PKHD1P08F94 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PKHD1P08F94 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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PKHD1P08F94 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PKHD1P08F94 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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