Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLK3P07288 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLK3P07288 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLK3P07288 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLK3P07288 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLK3P07288 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLK3P07288 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLK3P07288 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLK3P07288 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLK3P07288 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms