Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEFMP07197 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEFMP07197 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEFMP07197 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms