Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB3P05106 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms