Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTA1P02549 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms