Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTAP01040 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSTAP01040 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTAP01040 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms