Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRATO95237 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRATO95237 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRATO95237 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRATO95237 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRATO95237 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRATO95237 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRATO95237 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
LRATO95237 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRATO95237 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRATO95237 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRATO95237 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRATO95237 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRATO95237 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRATO95237 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRATO95237 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms