Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP5O75197 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP5O75197 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5O75197 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5O75197 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5O75197 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5O75197 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5O75197 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5O75197 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5O75197 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5O75197 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5O75197 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5O75197 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5O75197 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5O75197 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP5O75197 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms