Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms