Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SCN2BO60939 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SCN2BO60939 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SCN2BO60939 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SCN2BO60939 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SCN2BO60939 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SCN2BO60939 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCN2BO60939 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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