Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIAA0556O60303 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms