Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms