Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KIF3BO15066 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3BO15066 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3BO15066 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3BO15066 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3BO15066 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3BO15066 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3BO15066 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3BO15066 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3BO15066 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3BO15066 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3BO15066 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3BO15066 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3BO15066 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3BO15066 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIF3BO15066 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms